Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Meis3P97368 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis3P97368 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis3P97368 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis3P97368 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Meis3P97368 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis3P97368 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms