Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sec1P97353 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec1P97353 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec1P97353 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec1P97353 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec1P97353 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms