Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbx1P82976 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx1P82976 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx1P82976 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx1P82976 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx1P82976 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx1P82976 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx1P82976 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx1P82976 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx1P82976 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx1P82976 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx1P82976 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx1P82976 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms