Protein–RNA interactions for Protein: P82343

Renbp, N-acylglucosamine 2-epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RenbpP82343 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RenbpP82343 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RenbpP82343 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RenbpP82343 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RenbpP82343 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RenbpP82343 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RenbpP82343 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RenbpP82343 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RenbpP82343 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RenbpP82343 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RenbpP82343 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RenbpP82343 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RenbpP82343 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RenbpP82343 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RenbpP82343 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RenbpP82343 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RenbpP82343 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RenbpP82343 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RenbpP82343 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RenbpP82343 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RenbpP82343 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RenbpP82343 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RenbpP82343 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RenbpP82343 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RenbpP82343 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RenbpP82343 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RenbpP82343 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms