Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx3P81067 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx3P81067 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx3P81067 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx3P81067 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx3P81067 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx3P81067 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms