Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx2P80206 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx2P80206 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx2P80206 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx2P80206 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx2P80206 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx2P80206 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx2P80206 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx2P80206 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otx2P80206 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx2P80206 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms