Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CiitaP79621 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CiitaP79621 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CiitaP79621 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CiitaP79621 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CiitaP79621 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CiitaP79621 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CiitaP79621 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CiitaP79621 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CiitaP79621 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CiitaP79621 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms