Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Polr1bP70700 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Polr1bP70700 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Polr1bP70700 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Polr1bP70700 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Polr1bP70700 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Polr1bP70700 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Polr1bP70700 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Polr1bP70700 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Polr1bP70700 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Polr1bP70700 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Polr1bP70700 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Polr1bP70700 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Polr1bP70700 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms