Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms