Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ldb1P70662 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms