Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad50P70388 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rad50P70388 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad50P70388 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad50P70388 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad50P70388 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad50P70388 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad50P70388 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad50P70388 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad50P70388 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad50P70388 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad50P70388 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms