Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms