Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb13P70321 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hoxb13P70321 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms