Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkn1P70268 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms