Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabrb3P63080 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms