Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23P62830 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms