Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vsnl1P62761 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vsnl1P62761 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsnl1P62761 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsnl1P62761 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vsnl1P62761 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms