Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcbp1P60335 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcbp1P60335 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcbp1P60335 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms