Protein–RNA interactions for Protein: P59672

Anks1a, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks1aP59672 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Anks1aP59672 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Anks1aP59672 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Anks1aP59672 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Anks1aP59672 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Anks1aP59672 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Anks1aP59672 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Anks1aP59672 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Anks1aP59672 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Anks1aP59672 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms