Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp1P59054 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms