Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Uchl4P58321 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uchl4P58321 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms