Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snrpa1P57784 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms