Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmchP56942 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmchP56942 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmchP56942 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmchP56942 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmchP56942 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmchP56942 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmchP56942 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmchP56942 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmchP56942 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmchP56942 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmchP56942 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmchP56942 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmchP56942 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmchP56942 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmchP56942 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmchP56942 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmchP56942 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmchP56942 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmchP56942 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmchP56942 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmchP56942 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmchP56942 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmchP56942 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmchP56942 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmchP56942 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmchP56942 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmchP56942 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PmchP56942 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmchP56942 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmchP56942 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmchP56942 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmchP56942 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmchP56942 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmchP56942 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmchP56942 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmchP56942 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmchP56942 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmchP56942 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmchP56942 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmchP56942 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmchP56942 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmchP56942 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmchP56942 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmchP56942 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmchP56942 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmchP56942 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmchP56942 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmchP56942 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmchP56942 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmchP56942 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmchP56942 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmchP56942 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmchP56942 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmchP56942 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmchP56942 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmchP56942 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmchP56942 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmchP56942 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmchP56942 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmchP56942 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmchP56942 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmchP56942 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmchP56942 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmchP56942 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmchP56942 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmchP56942 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmchP56942 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmchP56942 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PmchP56942 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PmchP56942 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PmchP56942 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PmchP56942 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmchP56942 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmchP56942 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmchP56942 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmchP56942 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmchP56942 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmchP56942 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmchP56942 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmchP56942 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmchP56942 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmchP56942 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmchP56942 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmchP56942 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmchP56942 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmchP56942 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmchP56942 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmchP56942 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmchP56942 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmchP56942 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmchP56942 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmchP56942 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmchP56942 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmchP56942 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmchP56942 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmchP56942 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmchP56942 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmchP56942 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmchP56942 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms