Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gsc2P56916 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms