Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd38P56528 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd38P56528 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd38P56528 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd38P56528 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd38P56528 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd38P56528 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd38P56528 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd38P56528 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd38P56528 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms