Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab4aP56371 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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