Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcanP55066 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcanP55066 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcanP55066 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcanP55066 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcanP55066 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcanP55066 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcanP55066 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcanP55066 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcanP55066 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcanP55066 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcanP55066 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NcanP55066 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NcanP55066 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NcanP55066 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NcanP55066 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NcanP55066 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NcanP55066 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NcanP55066 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NcanP55066 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcanP55066 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcanP55066 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcanP55066 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NcanP55066 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcanP55066 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcanP55066 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcanP55066 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcanP55066 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcanP55066 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcanP55066 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcanP55066 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcanP55066 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcanP55066 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcanP55066 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcanP55066 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcanP55066 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcanP55066 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcanP55066 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcanP55066 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NcanP55066 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcanP55066 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NcanP55066 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NcanP55066 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NcanP55066 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NcanP55066 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NcanP55066 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NcanP55066 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NcanP55066 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NcanP55066 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NcanP55066 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NcanP55066 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NcanP55066 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NcanP55066 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcanP55066 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcanP55066 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcanP55066 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcanP55066 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcanP55066 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcanP55066 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcanP55066 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcanP55066 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcanP55066 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NcanP55066 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NcanP55066 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NcanP55066 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NcanP55066 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NcanP55066 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NcanP55066 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NcanP55066 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NcanP55066 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NcanP55066 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NcanP55066 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NcanP55066 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NcanP55066 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NcanP55066 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NcanP55066 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NcanP55066 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NcanP55066 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcanP55066 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcanP55066 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcanP55066 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcanP55066 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcanP55066 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcanP55066 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcanP55066 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NcanP55066 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcanP55066 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcanP55066 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NcanP55066 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NcanP55066 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NcanP55066 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NcanP55066 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NcanP55066 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NcanP55066 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NcanP55066 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NcanP55066 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NcanP55066 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NcanP55066 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NcanP55066 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NcanP55066 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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