Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efnb1P52795 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms