Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efna1P52793 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna1P52793 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna1P52793 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna1P52793 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna1P52793 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms