Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdi1P50396 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdi1P50396 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdi1P50396 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdi1P50396 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gdi1P50396 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms