Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl5P50228 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms