Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx2-1P50220 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx2-1P50220 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms