Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpreP49446 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpreP49446 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpreP49446 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpreP49446 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PtpreP49446 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpreP49446 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpreP49446 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpreP49446 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpreP49446 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms