Protein–RNA interactions for Protein: P49312

Hnrnpa1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa1P49312 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hnrnpa1P49312 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms