Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms