Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PfkmP47857 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PfkmP47857 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PfkmP47857 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfkmP47857 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PfkmP47857 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PfkmP47857 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PfkmP47857 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PfkmP47857 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PfkmP47857 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PfkmP47857 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PfkmP47857 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PfkmP47857 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PfkmP47857 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PfkmP47857 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms