Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tac1P41539 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tac1P41539 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tac1P41539 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tac1P41539 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tac1P41539 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms