Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc19a1P41438 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc19a1P41438 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc19a1P41438 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc19a1P41438 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc19a1P41438 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc19a1P41438 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms