Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox7P40646 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox7P40646 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox7P40646 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox7P40646 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox7P40646 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox7P40646 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox7P40646 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox7P40646 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox7P40646 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms