Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timp3P39876 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timp3P39876 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timp3P39876 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timp3P39876 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp3P39876 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp3P39876 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp3P39876 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms