Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpardP35396 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpardP35396 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpardP35396 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpardP35396 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpardP35396 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpardP35396 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpardP35396 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpardP35396 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpardP35396 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpardP35396 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PpardP35396 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PpardP35396 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PpardP35396 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PpardP35396 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PpardP35396 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PpardP35396 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PpardP35396 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PpardP35396 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PpardP35396 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PpardP35396 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PpardP35396 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PpardP35396 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PpardP35396 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PpardP35396 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PpardP35396 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PpardP35396 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PpardP35396 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PpardP35396 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PpardP35396 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PpardP35396 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PpardP35396 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PpardP35396 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PpardP35396 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PpardP35396 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PpardP35396 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PpardP35396 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PpardP35396 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpardP35396 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpardP35396 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpardP35396 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpardP35396 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpardP35396 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PpardP35396 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpardP35396 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpardP35396 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpardP35396 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpardP35396 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpardP35396 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpardP35396 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpardP35396 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpardP35396 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpardP35396 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PpardP35396 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpardP35396 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpardP35396 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpardP35396 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpardP35396 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpardP35396 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PpardP35396 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PpardP35396 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PpardP35396 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PpardP35396 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PpardP35396 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PpardP35396 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PpardP35396 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PpardP35396 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PpardP35396 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PpardP35396 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PpardP35396 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PpardP35396 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PpardP35396 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PpardP35396 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PpardP35396 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PpardP35396 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PpardP35396 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PpardP35396 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PpardP35396 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PpardP35396 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpardP35396 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpardP35396 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpardP35396 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpardP35396 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpardP35396 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpardP35396 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpardP35396 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpardP35396 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpardP35396 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms