Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sftpa1P35242 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sftpa1P35242 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms