Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms