Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptk2P34152 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ptk2P34152 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptk2P34152 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptk2P34152 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptk2P34152 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptk2P34152 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptk2P34152 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptk2P34152 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptk2P34152 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptk2P34152 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptk2P34152 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptk2P34152 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptk2P34152 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptk2P34152 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptk2P34152 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptk2P34152 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptk2P34152 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptk2P34152 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptk2P34152 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptk2P34152 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptk2P34152 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptk2P34152 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptk2P34152 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptk2P34152 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ptk2P34152 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptk2P34152 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptk2P34152 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptk2P34152 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ptk2P34152 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms