Protein–RNA interactions for Protein: P32972

Tnfsf8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf8P32972 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf8P32972 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf8P32972 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms