Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp3P28862 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms