Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RxraP28700 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RxraP28700 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RxraP28700 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RxraP28700 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RxraP28700 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RxraP28700 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RxraP28700 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RxraP28700 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RxraP28700 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RxraP28700 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RxraP28700 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RxraP28700 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RxraP28700 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RxraP28700 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RxraP28700 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RxraP28700 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RxraP28700 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RxraP28700 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RxraP28700 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RxraP28700 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RxraP28700 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RxraP28700 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RxraP28700 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RxraP28700 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RxraP28700 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RxraP28700 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RxraP28700 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RxraP28700 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RxraP28700 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RxraP28700 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RxraP28700 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RxraP28700 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RxraP28700 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RxraP28700 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RxraP28700 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RxraP28700 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RxraP28700 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RxraP28700 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RxraP28700 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RxraP28700 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RxraP28700 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RxraP28700 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RxraP28700 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RxraP28700 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RxraP28700 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RxraP28700 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RxraP28700 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RxraP28700 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RxraP28700 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RxraP28700 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RxraP28700 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RxraP28700 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RxraP28700 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RxraP28700 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RxraP28700 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RxraP28700 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RxraP28700 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RxraP28700 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RxraP28700 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RxraP28700 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RxraP28700 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RxraP28700 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RxraP28700 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RxraP28700 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RxraP28700 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RxraP28700 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RxraP28700 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RxraP28700 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RxraP28700 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RxraP28700 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RxraP28700 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RxraP28700 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RxraP28700 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RxraP28700 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RxraP28700 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RxraP28700 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RxraP28700 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RxraP28700 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RxraP28700 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RxraP28700 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RxraP28700 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RxraP28700 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RxraP28700 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RxraP28700 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RxraP28700 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RxraP28700 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RxraP28700 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RxraP28700 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RxraP28700 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RxraP28700 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RxraP28700 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RxraP28700 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RxraP28700 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RxraP28700 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RxraP28700 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RxraP28700 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RxraP28700 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RxraP28700 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RxraP28700 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms