Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsgP28293 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsgP28293 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsgP28293 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsgP28293 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsgP28293 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsgP28293 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms