Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb3P28231 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb3P28231 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb3P28231 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Gjb3P28231 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb3P28231 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb3P28231 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb3P28231 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb3P28231 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb3P28231 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb3P28231 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gjb3P28231 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb3P28231 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb3P28231 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb3P28231 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb3P28231 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb3P28231 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb3P28231 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb3P28231 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb3P28231 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb3P28231 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb3P28231 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb3P28231 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms