Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb1P28230 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb1P28230 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms